Большинство религий не поддерживает идей крионики, так как по их убеждениям душа после смерти покидает тело. Согласно базовым аспектам и канонам христианских верований, душа вряд ли сможет вернуться в то же тело, в каком была до момента физической смерти человека, после того, как она пройдет Суд Божий. Буддийская религия еще более категорична, так как согласно её заветам человек после смерти проходит перерождение, душа рождается в новом теле, поэтому тело, в котором она родилась в предыдущий раз, после смерти ей не будет нужно.

Религиозная философия говорит, что мозг управляет телом, а душа управляет мозгом. Тогда, даже если человека воскресить, и предположить даже, что он сможет выполнять какие-то действия, все это будет рефлекторно, души, а тем более, своего Я у него не будет. Однако можно встретить и иные мнения.

Некоторые православные мыслители считают, что именно крионика первый шаг на пути к всеобщему воскрешению. В защиту своей точки зрения крионики утверждают, что душа покидает тело, когда умирает мозг, а так как крионика не позволит клеткам умереть, то душа остается в человеке. В качестве примера приводят случаи восстановления людей после серьезных повреждений и травм мозга.